Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim29Q8R2Q0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms