Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Depp1Q8K2F3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms