Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mtmr3Q8K296 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mtmr3Q8K296 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mtmr3Q8K296 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mtmr3Q8K296 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mtmr3Q8K296 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mtmr3Q8K296 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mtmr3Q8K296 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mtmr3Q8K296 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mtmr3Q8K296 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mtmr3Q8K296 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mtmr3Q8K296 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Mtmr3Q8K296 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mtmr3Q8K296 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mtmr3Q8K296 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mtmr3Q8K296 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mtmr3Q8K296 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Mtmr3Q8K296 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mtmr3Q8K296 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mtmr3Q8K296 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mtmr3Q8K296 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mtmr3Q8K296 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mtmr3Q8K296 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mtmr3Q8K296 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mtmr3Q8K296 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mtmr3Q8K296 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mtmr3Q8K296 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mtmr3Q8K296 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Mtmr3Q8K296 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mtmr3Q8K296 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mtmr3Q8K296 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mtmr3Q8K296 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mtmr3Q8K296 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mtmr3Q8K296 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mtmr3Q8K296 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mtmr3Q8K296 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mtmr3Q8K296 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mtmr3Q8K296 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mtmr3Q8K296 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mtmr3Q8K296 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mtmr3Q8K296 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mtmr3Q8K296 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mtmr3Q8K296 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mtmr3Q8K296 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mtmr3Q8K296 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mtmr3Q8K296 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mtmr3Q8K296 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mtmr3Q8K296 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mtmr3Q8K296 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mtmr3Q8K296 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mtmr3Q8K296 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mtmr3Q8K296 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mtmr3Q8K296 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mtmr3Q8K296 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mtmr3Q8K296 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mtmr3Q8K296 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mtmr3Q8K296 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mtmr3Q8K296 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mtmr3Q8K296 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mtmr3Q8K296 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mtmr3Q8K296 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Mtmr3Q8K296 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mtmr3Q8K296 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Mtmr3Q8K296 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Mtmr3Q8K296 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mtmr3Q8K296 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mtmr3Q8K296 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mtmr3Q8K296 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mtmr3Q8K296 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mtmr3Q8K296 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mtmr3Q8K296 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Mtmr3Q8K296 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mtmr3Q8K296 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mtmr3Q8K296 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mtmr3Q8K296 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mtmr3Q8K296 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mtmr3Q8K296 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mtmr3Q8K296 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms