Protein–RNA interactions for Protein: Q8HWB2

H2-Q4, Histocompatibility 2, Q region locus 4, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q4Q8HWB2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
H2-Q4Q8HWB2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms