Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHX7

Rftn2, Raftlin-2, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn2Q8CHX7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rftn2Q8CHX7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rftn2Q8CHX7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rftn2Q8CHX7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rftn2Q8CHX7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rftn2Q8CHX7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rftn2Q8CHX7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rftn2Q8CHX7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rftn2Q8CHX7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rftn2Q8CHX7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rftn2Q8CHX7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rftn2Q8CHX7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rftn2Q8CHX7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rftn2Q8CHX7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rftn2Q8CHX7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rftn2Q8CHX7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rftn2Q8CHX7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rftn2Q8CHX7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rftn2Q8CHX7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rftn2Q8CHX7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rftn2Q8CHX7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rftn2Q8CHX7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rftn2Q8CHX7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rftn2Q8CHX7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rftn2Q8CHX7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rftn2Q8CHX7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rftn2Q8CHX7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rftn2Q8CHX7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rftn2Q8CHX7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rftn2Q8CHX7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rftn2Q8CHX7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rftn2Q8CHX7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rftn2Q8CHX7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rftn2Q8CHX7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rftn2Q8CHX7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rftn2Q8CHX7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rftn2Q8CHX7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rftn2Q8CHX7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rftn2Q8CHX7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rftn2Q8CHX7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rftn2Q8CHX7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rftn2Q8CHX7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rftn2Q8CHX7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rftn2Q8CHX7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms