Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Setd1bQ8CFT2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Setd1bQ8CFT2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Setd1bQ8CFT2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Setd1bQ8CFT2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Setd1bQ8CFT2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Setd1bQ8CFT2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Setd1bQ8CFT2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Setd1bQ8CFT2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Setd1bQ8CFT2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Setd1bQ8CFT2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Setd1bQ8CFT2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Setd1bQ8CFT2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Setd1bQ8CFT2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Setd1bQ8CFT2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Setd1bQ8CFT2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Setd1bQ8CFT2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Setd1bQ8CFT2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Setd1bQ8CFT2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Setd1bQ8CFT2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Setd1bQ8CFT2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Setd1bQ8CFT2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Setd1bQ8CFT2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Setd1bQ8CFT2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Setd1bQ8CFT2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Setd1bQ8CFT2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Setd1bQ8CFT2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Setd1bQ8CFT2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Setd1bQ8CFT2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Setd1bQ8CFT2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Setd1bQ8CFT2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Setd1bQ8CFT2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Setd1bQ8CFT2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Setd1bQ8CFT2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Setd1bQ8CFT2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Setd1bQ8CFT2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Setd1bQ8CFT2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Setd1bQ8CFT2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Setd1bQ8CFT2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Setd1bQ8CFT2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Setd1bQ8CFT2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Setd1bQ8CFT2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Setd1bQ8CFT2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Setd1bQ8CFT2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Setd1bQ8CFT2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Setd1bQ8CFT2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Setd1bQ8CFT2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Setd1bQ8CFT2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Setd1bQ8CFT2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Setd1bQ8CFT2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Setd1bQ8CFT2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Setd1bQ8CFT2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Setd1bQ8CFT2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Setd1bQ8CFT2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Setd1bQ8CFT2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Setd1bQ8CFT2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Setd1bQ8CFT2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Setd1bQ8CFT2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Setd1bQ8CFT2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Setd1bQ8CFT2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Setd1bQ8CFT2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Setd1bQ8CFT2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Setd1bQ8CFT2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Setd1bQ8CFT2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Setd1bQ8CFT2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Setd1bQ8CFT2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Setd1bQ8CFT2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Setd1bQ8CFT2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Setd1bQ8CFT2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Setd1bQ8CFT2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Setd1bQ8CFT2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Setd1bQ8CFT2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Setd1bQ8CFT2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Setd1bQ8CFT2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Setd1bQ8CFT2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Setd1bQ8CFT2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Setd1bQ8CFT2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Setd1bQ8CFT2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Setd1bQ8CFT2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Setd1bQ8CFT2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Setd1bQ8CFT2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Setd1bQ8CFT2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Setd1bQ8CFT2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Setd1bQ8CFT2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Setd1bQ8CFT2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Setd1bQ8CFT2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Setd1bQ8CFT2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Setd1bQ8CFT2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Setd1bQ8CFT2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Setd1bQ8CFT2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Setd1bQ8CFT2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Setd1bQ8CFT2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Setd1bQ8CFT2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Setd1bQ8CFT2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Setd1bQ8CFT2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Setd1bQ8CFT2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Setd1bQ8CFT2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Setd1bQ8CFT2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Setd1bQ8CFT2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Setd1bQ8CFT2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms