Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Brf1Q8CFK2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Brf1Q8CFK2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Brf1Q8CFK2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Brf1Q8CFK2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brf1Q8CFK2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brf1Q8CFK2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brf1Q8CFK2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brf1Q8CFK2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brf1Q8CFK2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brf1Q8CFK2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brf1Q8CFK2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brf1Q8CFK2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brf1Q8CFK2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brf1Q8CFK2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brf1Q8CFK2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brf1Q8CFK2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brf1Q8CFK2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brf1Q8CFK2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brf1Q8CFK2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brf1Q8CFK2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brf1Q8CFK2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Brf1Q8CFK2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brf1Q8CFK2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brf1Q8CFK2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brf1Q8CFK2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brf1Q8CFK2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brf1Q8CFK2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brf1Q8CFK2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brf1Q8CFK2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brf1Q8CFK2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brf1Q8CFK2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brf1Q8CFK2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brf1Q8CFK2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brf1Q8CFK2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brf1Q8CFK2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brf1Q8CFK2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Brf1Q8CFK2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brf1Q8CFK2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brf1Q8CFK2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brf1Q8CFK2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brf1Q8CFK2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brf1Q8CFK2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brf1Q8CFK2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms