Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE33

Klhl11, Kelch-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl11Q8CE33 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl11Q8CE33 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl11Q8CE33 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl11Q8CE33 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl11Q8CE33 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl11Q8CE33 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhl11Q8CE33 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhl11Q8CE33 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhl11Q8CE33 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhl11Q8CE33 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhl11Q8CE33 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhl11Q8CE33 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhl11Q8CE33 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhl11Q8CE33 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhl11Q8CE33 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhl11Q8CE33 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhl11Q8CE33 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhl11Q8CE33 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhl11Q8CE33 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl11Q8CE33 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl11Q8CE33 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl11Q8CE33 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl11Q8CE33 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl11Q8CE33 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl11Q8CE33 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl11Q8CE33 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl11Q8CE33 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl11Q8CE33 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl11Q8CE33 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl11Q8CE33 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl11Q8CE33 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhl11Q8CE33 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhl11Q8CE33 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhl11Q8CE33 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhl11Q8CE33 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhl11Q8CE33 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhl11Q8CE33 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhl11Q8CE33 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhl11Q8CE33 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhl11Q8CE33 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhl11Q8CE33 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhl11Q8CE33 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhl11Q8CE33 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhl11Q8CE33 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhl11Q8CE33 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Klhl11Q8CE33 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhl11Q8CE33 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhl11Q8CE33 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhl11Q8CE33 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhl11Q8CE33 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhl11Q8CE33 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl11Q8CE33 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl11Q8CE33 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl11Q8CE33 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl11Q8CE33 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl11Q8CE33 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl11Q8CE33 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl11Q8CE33 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl11Q8CE33 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhl11Q8CE33 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhl11Q8CE33 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhl11Q8CE33 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhl11Q8CE33 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhl11Q8CE33 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhl11Q8CE33 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhl11Q8CE33 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhl11Q8CE33 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhl11Q8CE33 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhl11Q8CE33 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhl11Q8CE33 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhl11Q8CE33 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhl11Q8CE33 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhl11Q8CE33 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhl11Q8CE33 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhl11Q8CE33 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhl11Q8CE33 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhl11Q8CE33 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhl11Q8CE33 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhl11Q8CE33 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhl11Q8CE33 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhl11Q8CE33 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhl11Q8CE33 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhl11Q8CE33 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhl11Q8CE33 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhl11Q8CE33 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhl11Q8CE33 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhl11Q8CE33 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhl11Q8CE33 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhl11Q8CE33 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhl11Q8CE33 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhl11Q8CE33 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klhl11Q8CE33 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klhl11Q8CE33 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klhl11Q8CE33 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klhl11Q8CE33 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Klhl11Q8CE33 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Klhl11Q8CE33 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Klhl11Q8CE33 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Klhl11Q8CE33 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Klhl11Q8CE33 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms