Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD15

Riox2, Ribosomal oxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox2Q8CD15 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Riox2Q8CD15 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Riox2Q8CD15 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Riox2Q8CD15 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms