Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bhlhe22Q8C6A8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bhlhe22Q8C6A8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bhlhe22Q8C6A8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bhlhe22Q8C6A8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bhlhe22Q8C6A8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bhlhe22Q8C6A8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bhlhe22Q8C6A8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bhlhe22Q8C6A8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bhlhe22Q8C6A8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bhlhe22Q8C6A8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bhlhe22Q8C6A8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bhlhe22Q8C6A8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bhlhe22Q8C6A8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Bhlhe22Q8C6A8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bhlhe22Q8C6A8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bhlhe22Q8C6A8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Bhlhe22Q8C6A8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms