Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hdac7Q8C2B3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hdac7Q8C2B3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hdac7Q8C2B3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hdac7Q8C2B3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hdac7Q8C2B3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hdac7Q8C2B3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hdac7Q8C2B3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hdac7Q8C2B3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hdac7Q8C2B3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hdac7Q8C2B3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hdac7Q8C2B3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hdac7Q8C2B3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hdac7Q8C2B3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hdac7Q8C2B3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hdac7Q8C2B3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Hdac7Q8C2B3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Hdac7Q8C2B3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hdac7Q8C2B3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hdac7Q8C2B3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hdac7Q8C2B3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hdac7Q8C2B3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hdac7Q8C2B3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hdac7Q8C2B3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hdac7Q8C2B3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hdac7Q8C2B3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hdac7Q8C2B3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hdac7Q8C2B3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Hdac7Q8C2B3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hdac7Q8C2B3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdac7Q8C2B3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdac7Q8C2B3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdac7Q8C2B3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdac7Q8C2B3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdac7Q8C2B3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdac7Q8C2B3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdac7Q8C2B3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdac7Q8C2B3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hdac7Q8C2B3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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