Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUV3

Gphn, Gephyrin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GphnQ8BUV3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GphnQ8BUV3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GphnQ8BUV3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GphnQ8BUV3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GphnQ8BUV3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GphnQ8BUV3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GphnQ8BUV3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GphnQ8BUV3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GphnQ8BUV3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GphnQ8BUV3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
GphnQ8BUV3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GphnQ8BUV3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GphnQ8BUV3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GphnQ8BUV3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GphnQ8BUV3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GphnQ8BUV3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GphnQ8BUV3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GphnQ8BUV3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GphnQ8BUV3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GphnQ8BUV3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GphnQ8BUV3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GphnQ8BUV3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GphnQ8BUV3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GphnQ8BUV3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GphnQ8BUV3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GphnQ8BUV3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GphnQ8BUV3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GphnQ8BUV3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GphnQ8BUV3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GphnQ8BUV3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GphnQ8BUV3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GphnQ8BUV3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GphnQ8BUV3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GphnQ8BUV3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GphnQ8BUV3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GphnQ8BUV3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GphnQ8BUV3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GphnQ8BUV3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GphnQ8BUV3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GphnQ8BUV3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GphnQ8BUV3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
GphnQ8BUV3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GphnQ8BUV3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GphnQ8BUV3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
GphnQ8BUV3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GphnQ8BUV3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GphnQ8BUV3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GphnQ8BUV3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
GphnQ8BUV3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
GphnQ8BUV3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
GphnQ8BUV3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GphnQ8BUV3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GphnQ8BUV3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
GphnQ8BUV3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
GphnQ8BUV3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
GphnQ8BUV3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
GphnQ8BUV3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GphnQ8BUV3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
GphnQ8BUV3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GphnQ8BUV3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GphnQ8BUV3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GphnQ8BUV3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GphnQ8BUV3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GphnQ8BUV3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GphnQ8BUV3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GphnQ8BUV3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GphnQ8BUV3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GphnQ8BUV3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GphnQ8BUV3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GphnQ8BUV3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
GphnQ8BUV3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GphnQ8BUV3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GphnQ8BUV3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GphnQ8BUV3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GphnQ8BUV3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GphnQ8BUV3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GphnQ8BUV3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GphnQ8BUV3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GphnQ8BUV3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GphnQ8BUV3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GphnQ8BUV3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GphnQ8BUV3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GphnQ8BUV3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GphnQ8BUV3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GphnQ8BUV3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GphnQ8BUV3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GphnQ8BUV3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GphnQ8BUV3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GphnQ8BUV3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
GphnQ8BUV3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GphnQ8BUV3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GphnQ8BUV3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GphnQ8BUV3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GphnQ8BUV3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GphnQ8BUV3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GphnQ8BUV3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GphnQ8BUV3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GphnQ8BUV3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GphnQ8BUV3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GphnQ8BUV3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms