Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PcgF3Q8BTQ0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms