Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW8

Vgll2, Transcription cofactor vestigial-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll2Q8BGW8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vgll2Q8BGW8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vgll2Q8BGW8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Vgll2Q8BGW8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vgll2Q8BGW8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vgll2Q8BGW8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vgll2Q8BGW8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vgll2Q8BGW8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vgll2Q8BGW8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vgll2Q8BGW8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vgll2Q8BGW8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vgll2Q8BGW8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vgll2Q8BGW8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vgll2Q8BGW8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vgll2Q8BGW8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vgll2Q8BGW8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vgll2Q8BGW8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vgll2Q8BGW8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vgll2Q8BGW8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vgll2Q8BGW8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vgll2Q8BGW8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vgll2Q8BGW8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vgll2Q8BGW8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vgll2Q8BGW8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vgll2Q8BGW8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vgll2Q8BGW8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vgll2Q8BGW8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vgll2Q8BGW8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vgll2Q8BGW8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vgll2Q8BGW8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Vgll2Q8BGW8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vgll2Q8BGW8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vgll2Q8BGW8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vgll2Q8BGW8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vgll2Q8BGW8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vgll2Q8BGW8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vgll2Q8BGW8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vgll2Q8BGW8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Vgll2Q8BGW8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Vgll2Q8BGW8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vgll2Q8BGW8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vgll2Q8BGW8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vgll2Q8BGW8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vgll2Q8BGW8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vgll2Q8BGW8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vgll2Q8BGW8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vgll2Q8BGW8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Vgll2Q8BGW8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vgll2Q8BGW8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms