Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cyp4f39Q8BGU0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms