Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms