Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMR0

Prcp, Lysosomal Pro-X carboxypeptidase, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcpQ7TMR0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrcpQ7TMR0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrcpQ7TMR0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrcpQ7TMR0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrcpQ7TMR0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrcpQ7TMR0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrcpQ7TMR0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PrcpQ7TMR0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrcpQ7TMR0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrcpQ7TMR0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrcpQ7TMR0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrcpQ7TMR0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PrcpQ7TMR0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrcpQ7TMR0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrcpQ7TMR0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrcpQ7TMR0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PrcpQ7TMR0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.28■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrcpQ7TMR0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrcpQ7TMR0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PrcpQ7TMR0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrcpQ7TMR0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrcpQ7TMR0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrcpQ7TMR0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrcpQ7TMR0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrcpQ7TMR0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrcpQ7TMR0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrcpQ7TMR0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrcpQ7TMR0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrcpQ7TMR0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrcpQ7TMR0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrcpQ7TMR0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrcpQ7TMR0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrcpQ7TMR0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrcpQ7TMR0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrcpQ7TMR0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrcpQ7TMR0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms