Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpl35Q6ZWV7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl35Q6ZWV7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl35Q6ZWV7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl35Q6ZWV7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl35Q6ZWV7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl35Q6ZWV7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl35Q6ZWV7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl35Q6ZWV7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl35Q6ZWV7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl35Q6ZWV7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl35Q6ZWV7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl35Q6ZWV7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl35Q6ZWV7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl35Q6ZWV7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl35Q6ZWV7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl35Q6ZWV7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl35Q6ZWV7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl35Q6ZWV7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl35Q6ZWV7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl35Q6ZWV7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl35Q6ZWV7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl35Q6ZWV7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl35Q6ZWV7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl35Q6ZWV7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl35Q6ZWV7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl35Q6ZWV7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl35Q6ZWV7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl35Q6ZWV7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl35Q6ZWV7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl35Q6ZWV7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl35Q6ZWV7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl35Q6ZWV7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl35Q6ZWV7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl35Q6ZWV7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl35Q6ZWV7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl35Q6ZWV7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl35Q6ZWV7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl35Q6ZWV7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl35Q6ZWV7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl35Q6ZWV7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl35Q6ZWV7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl35Q6ZWV7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms