Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SpopQ6ZWS8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SpopQ6ZWS8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SpopQ6ZWS8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SpopQ6ZWS8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SpopQ6ZWS8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SpopQ6ZWS8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SpopQ6ZWS8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SpopQ6ZWS8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SpopQ6ZWS8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SpopQ6ZWS8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SpopQ6ZWS8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SpopQ6ZWS8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SpopQ6ZWS8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SpopQ6ZWS8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SpopQ6ZWS8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SpopQ6ZWS8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SpopQ6ZWS8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SpopQ6ZWS8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SpopQ6ZWS8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SpopQ6ZWS8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SpopQ6ZWS8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SpopQ6ZWS8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SpopQ6ZWS8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SpopQ6ZWS8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SpopQ6ZWS8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SpopQ6ZWS8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SpopQ6ZWS8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SpopQ6ZWS8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SpopQ6ZWS8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SpopQ6ZWS8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SpopQ6ZWS8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SpopQ6ZWS8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SpopQ6ZWS8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SpopQ6ZWS8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SpopQ6ZWS8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SpopQ6ZWS8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SpopQ6ZWS8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SpopQ6ZWS8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SpopQ6ZWS8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SpopQ6ZWS8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SpopQ6ZWS8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SpopQ6ZWS8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SpopQ6ZWS8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SpopQ6ZWS8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SpopQ6ZWS8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms