Protein–RNA interactions for Protein: Q6T3U4

Npc1l1, Niemann-Pick C1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npc1l1Q6T3U4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Npc1l1Q6T3U4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Npc1l1Q6T3U4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Npc1l1Q6T3U4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Npc1l1Q6T3U4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Npc1l1Q6T3U4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Npc1l1Q6T3U4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Npc1l1Q6T3U4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Npc1l1Q6T3U4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Npc1l1Q6T3U4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Npc1l1Q6T3U4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Npc1l1Q6T3U4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Npc1l1Q6T3U4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Npc1l1Q6T3U4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Npc1l1Q6T3U4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Npc1l1Q6T3U4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Npc1l1Q6T3U4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Npc1l1Q6T3U4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Npc1l1Q6T3U4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Npc1l1Q6T3U4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Npc1l1Q6T3U4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.47
Npc1l1Q6T3U4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Npc1l1Q6T3U4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Npc1l1Q6T3U4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Npc1l1Q6T3U4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Npc1l1Q6T3U4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Npc1l1Q6T3U4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Npc1l1Q6T3U4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Npc1l1Q6T3U4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Npc1l1Q6T3U4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Npc1l1Q6T3U4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Npc1l1Q6T3U4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Npc1l1Q6T3U4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Npc1l1Q6T3U4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Npc1l1Q6T3U4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Npc1l1Q6T3U4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Npc1l1Q6T3U4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Npc1l1Q6T3U4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Npc1l1Q6T3U4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Npc1l1Q6T3U4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Npc1l1Q6T3U4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Npc1l1Q6T3U4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Npc1l1Q6T3U4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Npc1l1Q6T3U4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Npc1l1Q6T3U4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Npc1l1Q6T3U4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Npc1l1Q6T3U4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Npc1l1Q6T3U4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Npc1l1Q6T3U4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Npc1l1Q6T3U4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Npc1l1Q6T3U4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Npc1l1Q6T3U4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Npc1l1Q6T3U4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Npc1l1Q6T3U4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Npc1l1Q6T3U4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Npc1l1Q6T3U4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Npc1l1Q6T3U4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Npc1l1Q6T3U4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Npc1l1Q6T3U4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Npc1l1Q6T3U4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Npc1l1Q6T3U4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Npc1l1Q6T3U4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Npc1l1Q6T3U4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Npc1l1Q6T3U4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Npc1l1Q6T3U4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Npc1l1Q6T3U4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Npc1l1Q6T3U4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Npc1l1Q6T3U4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Npc1l1Q6T3U4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Npc1l1Q6T3U4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Npc1l1Q6T3U4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Npc1l1Q6T3U4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Npc1l1Q6T3U4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Npc1l1Q6T3U4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Npc1l1Q6T3U4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Npc1l1Q6T3U4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Npc1l1Q6T3U4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Npc1l1Q6T3U4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Npc1l1Q6T3U4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Npc1l1Q6T3U4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Npc1l1Q6T3U4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Npc1l1Q6T3U4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Npc1l1Q6T3U4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Npc1l1Q6T3U4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Npc1l1Q6T3U4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Npc1l1Q6T3U4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Npc1l1Q6T3U4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Npc1l1Q6T3U4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Npc1l1Q6T3U4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Npc1l1Q6T3U4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Npc1l1Q6T3U4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Npc1l1Q6T3U4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Npc1l1Q6T3U4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Npc1l1Q6T3U4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Npc1l1Q6T3U4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Npc1l1Q6T3U4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Npc1l1Q6T3U4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Npc1l1Q6T3U4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Npc1l1Q6T3U4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Npc1l1Q6T3U4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms