Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q477

Atp2b4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b4Q6Q477 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp2b4Q6Q477 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp2b4Q6Q477 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp2b4Q6Q477 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atp2b4Q6Q477 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp2b4Q6Q477 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp2b4Q6Q477 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp2b4Q6Q477 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp2b4Q6Q477 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp2b4Q6Q477 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp2b4Q6Q477 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp2b4Q6Q477 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp2b4Q6Q477 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp2b4Q6Q477 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp2b4Q6Q477 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp2b4Q6Q477 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp2b4Q6Q477 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp2b4Q6Q477 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp2b4Q6Q477 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp2b4Q6Q477 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp2b4Q6Q477 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp2b4Q6Q477 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp2b4Q6Q477 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp2b4Q6Q477 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp2b4Q6Q477 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp2b4Q6Q477 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp2b4Q6Q477 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp2b4Q6Q477 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp2b4Q6Q477 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp2b4Q6Q477 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp2b4Q6Q477 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp2b4Q6Q477 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp2b4Q6Q477 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp2b4Q6Q477 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp2b4Q6Q477 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp2b4Q6Q477 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp2b4Q6Q477 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp2b4Q6Q477 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp2b4Q6Q477 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp2b4Q6Q477 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp2b4Q6Q477 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp2b4Q6Q477 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp2b4Q6Q477 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp2b4Q6Q477 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp2b4Q6Q477 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp2b4Q6Q477 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp2b4Q6Q477 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp2b4Q6Q477 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp2b4Q6Q477 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atp2b4Q6Q477 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atp2b4Q6Q477 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp2b4Q6Q477 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp2b4Q6Q477 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp2b4Q6Q477 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp2b4Q6Q477 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp2b4Q6Q477 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp2b4Q6Q477 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp2b4Q6Q477 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp2b4Q6Q477 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp2b4Q6Q477 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp2b4Q6Q477 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp2b4Q6Q477 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp2b4Q6Q477 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp2b4Q6Q477 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp2b4Q6Q477 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp2b4Q6Q477 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp2b4Q6Q477 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp2b4Q6Q477 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp2b4Q6Q477 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp2b4Q6Q477 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp2b4Q6Q477 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2b4Q6Q477 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2b4Q6Q477 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2b4Q6Q477 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2b4Q6Q477 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2b4Q6Q477 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2b4Q6Q477 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2b4Q6Q477 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2b4Q6Q477 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2b4Q6Q477 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2b4Q6Q477 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp2b4Q6Q477 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp2b4Q6Q477 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp2b4Q6Q477 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp2b4Q6Q477 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp2b4Q6Q477 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp2b4Q6Q477 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp2b4Q6Q477 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp2b4Q6Q477 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp2b4Q6Q477 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp2b4Q6Q477 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp2b4Q6Q477 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp2b4Q6Q477 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp2b4Q6Q477 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp2b4Q6Q477 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp2b4Q6Q477 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms