Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ4

Nfrkb, Nuclear factor related to kappa-B-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfrkbQ6PIJ4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfrkbQ6PIJ4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfrkbQ6PIJ4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfrkbQ6PIJ4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfrkbQ6PIJ4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfrkbQ6PIJ4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfrkbQ6PIJ4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfrkbQ6PIJ4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfrkbQ6PIJ4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfrkbQ6PIJ4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfrkbQ6PIJ4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NfrkbQ6PIJ4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NfrkbQ6PIJ4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NfrkbQ6PIJ4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NfrkbQ6PIJ4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NfrkbQ6PIJ4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NfrkbQ6PIJ4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NfrkbQ6PIJ4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NfrkbQ6PIJ4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NfrkbQ6PIJ4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NfrkbQ6PIJ4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NfrkbQ6PIJ4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NfrkbQ6PIJ4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NfrkbQ6PIJ4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NfrkbQ6PIJ4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NfrkbQ6PIJ4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NfrkbQ6PIJ4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NfrkbQ6PIJ4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NfrkbQ6PIJ4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NfrkbQ6PIJ4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NfrkbQ6PIJ4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NfrkbQ6PIJ4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NfrkbQ6PIJ4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NfrkbQ6PIJ4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfrkbQ6PIJ4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NfrkbQ6PIJ4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfrkbQ6PIJ4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfrkbQ6PIJ4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfrkbQ6PIJ4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfrkbQ6PIJ4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfrkbQ6PIJ4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfrkbQ6PIJ4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NfrkbQ6PIJ4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NfrkbQ6PIJ4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NfrkbQ6PIJ4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NfrkbQ6PIJ4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfrkbQ6PIJ4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfrkbQ6PIJ4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfrkbQ6PIJ4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NfrkbQ6PIJ4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfrkbQ6PIJ4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfrkbQ6PIJ4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfrkbQ6PIJ4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfrkbQ6PIJ4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfrkbQ6PIJ4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfrkbQ6PIJ4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfrkbQ6PIJ4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfrkbQ6PIJ4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfrkbQ6PIJ4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfrkbQ6PIJ4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfrkbQ6PIJ4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfrkbQ6PIJ4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfrkbQ6PIJ4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NfrkbQ6PIJ4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
NfrkbQ6PIJ4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NfrkbQ6PIJ4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NfrkbQ6PIJ4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.2 ms