Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4U0

Thsd7b, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7bQ6P4U0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Thsd7bQ6P4U0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Thsd7bQ6P4U0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Thsd7bQ6P4U0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Thsd7bQ6P4U0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Thsd7bQ6P4U0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Thsd7bQ6P4U0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Thsd7bQ6P4U0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Thsd7bQ6P4U0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Thsd7bQ6P4U0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Thsd7bQ6P4U0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Thsd7bQ6P4U0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Thsd7bQ6P4U0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Thsd7bQ6P4U0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Thsd7bQ6P4U0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Thsd7bQ6P4U0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Thsd7bQ6P4U0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Thsd7bQ6P4U0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Thsd7bQ6P4U0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Thsd7bQ6P4U0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Thsd7bQ6P4U0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Thsd7bQ6P4U0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Thsd7bQ6P4U0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Thsd7bQ6P4U0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Thsd7bQ6P4U0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Thsd7bQ6P4U0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Thsd7bQ6P4U0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Thsd7bQ6P4U0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Thsd7bQ6P4U0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Thsd7bQ6P4U0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Thsd7bQ6P4U0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Thsd7bQ6P4U0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Thsd7bQ6P4U0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Thsd7bQ6P4U0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Thsd7bQ6P4U0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Thsd7bQ6P4U0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Thsd7bQ6P4U0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Thsd7bQ6P4U0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Thsd7bQ6P4U0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Thsd7bQ6P4U0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Thsd7bQ6P4U0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Thsd7bQ6P4U0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Thsd7bQ6P4U0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms