Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ParpbpQ6IRT3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ParpbpQ6IRT3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ParpbpQ6IRT3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ParpbpQ6IRT3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ParpbpQ6IRT3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ParpbpQ6IRT3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ParpbpQ6IRT3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ParpbpQ6IRT3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ParpbpQ6IRT3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ParpbpQ6IRT3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ParpbpQ6IRT3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ParpbpQ6IRT3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ParpbpQ6IRT3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ParpbpQ6IRT3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ParpbpQ6IRT3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ParpbpQ6IRT3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ParpbpQ6IRT3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ParpbpQ6IRT3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ParpbpQ6IRT3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ParpbpQ6IRT3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ParpbpQ6IRT3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ParpbpQ6IRT3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ParpbpQ6IRT3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ParpbpQ6IRT3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ParpbpQ6IRT3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ParpbpQ6IRT3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ParpbpQ6IRT3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ParpbpQ6IRT3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ParpbpQ6IRT3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms