Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atg9bQ6EBV9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg9bQ6EBV9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg9bQ6EBV9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg9bQ6EBV9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg9bQ6EBV9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg9bQ6EBV9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg9bQ6EBV9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg9bQ6EBV9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg9bQ6EBV9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg9bQ6EBV9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg9bQ6EBV9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg9bQ6EBV9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg9bQ6EBV9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg9bQ6EBV9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg9bQ6EBV9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg9bQ6EBV9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg9bQ6EBV9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg9bQ6EBV9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg9bQ6EBV9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg9bQ6EBV9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg9bQ6EBV9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg9bQ6EBV9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg9bQ6EBV9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg9bQ6EBV9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg9bQ6EBV9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg9bQ6EBV9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg9bQ6EBV9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg9bQ6EBV9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg9bQ6EBV9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg9bQ6EBV9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg9bQ6EBV9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg9bQ6EBV9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg9bQ6EBV9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg9bQ6EBV9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg9bQ6EBV9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg9bQ6EBV9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg9bQ6EBV9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg9bQ6EBV9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg9bQ6EBV9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg9bQ6EBV9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg9bQ6EBV9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg9bQ6EBV9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg9bQ6EBV9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg9bQ6EBV9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg9bQ6EBV9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg9bQ6EBV9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg9bQ6EBV9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Atg9bQ6EBV9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg9bQ6EBV9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg9bQ6EBV9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg9bQ6EBV9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg9bQ6EBV9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg9bQ6EBV9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg9bQ6EBV9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg9bQ6EBV9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg9bQ6EBV9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg9bQ6EBV9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg9bQ6EBV9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg9bQ6EBV9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg9bQ6EBV9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg9bQ6EBV9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg9bQ6EBV9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg9bQ6EBV9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg9bQ6EBV9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg9bQ6EBV9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg9bQ6EBV9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg9bQ6EBV9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg9bQ6EBV9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg9bQ6EBV9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg9bQ6EBV9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg9bQ6EBV9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg9bQ6EBV9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms