Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Smarca2Q6DIC0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Smarca2Q6DIC0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Smarca2Q6DIC0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Smarca2Q6DIC0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Smarca2Q6DIC0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Smarca2Q6DIC0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
Smarca2Q6DIC0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
Smarca2Q6DIC0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Smarca2Q6DIC0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Smarca2Q6DIC0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Smarca2Q6DIC0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Smarca2Q6DIC0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Smarca2Q6DIC0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Smarca2Q6DIC0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Smarca2Q6DIC0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Smarca2Q6DIC0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
Smarca2Q6DIC0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Smarca2Q6DIC0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
Smarca2Q6DIC0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Smarca2Q6DIC0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Smarca2Q6DIC0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
Smarca2Q6DIC0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Smarca2Q6DIC0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Smarca2Q6DIC0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Smarca2Q6DIC0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Smarca2Q6DIC0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Smarca2Q6DIC0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Smarca2Q6DIC0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Smarca2Q6DIC0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Smarca2Q6DIC0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Smarca2Q6DIC0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Smarca2Q6DIC0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Smarca2Q6DIC0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
Smarca2Q6DIC0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Smarca2Q6DIC0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
Smarca2Q6DIC0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Smarca2Q6DIC0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
Smarca2Q6DIC0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Smarca2Q6DIC0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Smarca2Q6DIC0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Smarca2Q6DIC0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Smarca2Q6DIC0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Smarca2Q6DIC0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Smarca2Q6DIC0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Smarca2Q6DIC0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Smarca2Q6DIC0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Smarca2Q6DIC0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Smarca2Q6DIC0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Smarca2Q6DIC0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Smarca2Q6DIC0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Smarca2Q6DIC0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Smarca2Q6DIC0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Smarca2Q6DIC0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Smarca2Q6DIC0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Smarca2Q6DIC0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Smarca2Q6DIC0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Smarca2Q6DIC0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Smarca2Q6DIC0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Smarca2Q6DIC0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Smarca2Q6DIC0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Smarca2Q6DIC0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Smarca2Q6DIC0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Smarca2Q6DIC0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Smarca2Q6DIC0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Smarca2Q6DIC0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Smarca2Q6DIC0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Smarca2Q6DIC0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Smarca2Q6DIC0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Smarca2Q6DIC0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Smarca2Q6DIC0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
Smarca2Q6DIC0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
Smarca2Q6DIC0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Smarca2Q6DIC0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Smarca2Q6DIC0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
Smarca2Q6DIC0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Smarca2Q6DIC0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Smarca2Q6DIC0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Smarca2Q6DIC0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Smarca2Q6DIC0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Smarca2Q6DIC0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Smarca2Q6DIC0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Smarca2Q6DIC0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Smarca2Q6DIC0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Smarca2Q6DIC0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Smarca2Q6DIC0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Smarca2Q6DIC0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Smarca2Q6DIC0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Smarca2Q6DIC0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
Smarca2Q6DIC0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
Smarca2Q6DIC0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Smarca2Q6DIC0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Smarca2Q6DIC0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Smarca2Q6DIC0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Smarca2Q6DIC0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Smarca2Q6DIC0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Smarca2Q6DIC0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Smarca2Q6DIC0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Smarca2Q6DIC0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
Smarca2Q6DIC0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms