Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kiaa1549Q68FD9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kiaa1549Q68FD9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Kiaa1549Q68FD9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kiaa1549Q68FD9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kiaa1549Q68FD9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kiaa1549Q68FD9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kiaa1549Q68FD9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kiaa1549Q68FD9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kiaa1549Q68FD9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kiaa1549Q68FD9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Kiaa1549Q68FD9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kiaa1549Q68FD9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kiaa1549Q68FD9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kiaa1549Q68FD9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Kiaa1549Q68FD9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kiaa1549Q68FD9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kiaa1549Q68FD9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kiaa1549Q68FD9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kiaa1549Q68FD9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kiaa1549Q68FD9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kiaa1549Q68FD9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kiaa1549Q68FD9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kiaa1549Q68FD9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kiaa1549Q68FD9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kiaa1549Q68FD9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kiaa1549Q68FD9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kiaa1549Q68FD9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kiaa1549Q68FD9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kiaa1549Q68FD9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kiaa1549Q68FD9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kiaa1549Q68FD9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kiaa1549Q68FD9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kiaa1549Q68FD9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms