Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CltcQ68FD5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CltcQ68FD5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CltcQ68FD5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CltcQ68FD5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CltcQ68FD5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CltcQ68FD5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CltcQ68FD5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CltcQ68FD5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CltcQ68FD5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CltcQ68FD5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CltcQ68FD5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CltcQ68FD5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CltcQ68FD5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CltcQ68FD5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CltcQ68FD5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CltcQ68FD5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CltcQ68FD5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CltcQ68FD5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CltcQ68FD5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CltcQ68FD5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CltcQ68FD5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CltcQ68FD5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CltcQ68FD5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CltcQ68FD5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CltcQ68FD5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CltcQ68FD5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CltcQ68FD5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CltcQ68FD5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CltcQ68FD5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CltcQ68FD5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CltcQ68FD5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CltcQ68FD5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CltcQ68FD5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CltcQ68FD5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CltcQ68FD5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CltcQ68FD5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CltcQ68FD5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CltcQ68FD5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CltcQ68FD5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CltcQ68FD5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CltcQ68FD5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CltcQ68FD5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CltcQ68FD5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CltcQ68FD5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CltcQ68FD5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CltcQ68FD5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CltcQ68FD5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CltcQ68FD5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CltcQ68FD5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CltcQ68FD5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CltcQ68FD5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CltcQ68FD5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CltcQ68FD5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CltcQ68FD5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CltcQ68FD5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CltcQ68FD5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CltcQ68FD5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CltcQ68FD5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CltcQ68FD5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CltcQ68FD5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CltcQ68FD5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CltcQ68FD5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CltcQ68FD5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CltcQ68FD5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CltcQ68FD5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CltcQ68FD5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CltcQ68FD5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CltcQ68FD5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CltcQ68FD5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CltcQ68FD5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CltcQ68FD5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CltcQ68FD5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CltcQ68FD5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CltcQ68FD5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CltcQ68FD5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CltcQ68FD5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CltcQ68FD5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CltcQ68FD5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CltcQ68FD5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CltcQ68FD5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CltcQ68FD5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CltcQ68FD5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CltcQ68FD5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CltcQ68FD5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CltcQ68FD5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CltcQ68FD5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CltcQ68FD5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CltcQ68FD5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CltcQ68FD5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CltcQ68FD5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CltcQ68FD5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CltcQ68FD5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CltcQ68FD5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CltcQ68FD5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CltcQ68FD5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CltcQ68FD5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CltcQ68FD5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CltcQ68FD5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CltcQ68FD5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms