Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zic2Q62520 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zic2Q62520 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zic2Q62520 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zic2Q62520 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zic2Q62520 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zic2Q62520 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zic2Q62520 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zic2Q62520 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zic2Q62520 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zic2Q62520 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zic2Q62520 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zic2Q62520 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zic2Q62520 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zic2Q62520 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zic2Q62520 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zic2Q62520 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zic2Q62520 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zic2Q62520 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zic2Q62520 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zic2Q62520 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zic2Q62520 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zic2Q62520 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zic2Q62520 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zic2Q62520 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Zic2Q62520 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms