Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CochQ62507 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CochQ62507 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CochQ62507 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CochQ62507 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CochQ62507 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CochQ62507 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CochQ62507 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CochQ62507 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CochQ62507 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CochQ62507 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CochQ62507 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CochQ62507 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CochQ62507 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CochQ62507 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CochQ62507 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CochQ62507 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CochQ62507 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CochQ62507 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CochQ62507 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CochQ62507 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CochQ62507 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CochQ62507 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CochQ62507 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CochQ62507 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CochQ62507 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CochQ62507 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CochQ62507 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CochQ62507 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CochQ62507 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CochQ62507 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CochQ62507 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CochQ62507 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CochQ62507 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CochQ62507 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CochQ62507 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CochQ62507 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CochQ62507 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CochQ62507 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CochQ62507 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CochQ62507 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CochQ62507 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CochQ62507 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CochQ62507 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CochQ62507 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CochQ62507 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CochQ62507 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CochQ62507 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CochQ62507 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CochQ62507 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CochQ62507 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CochQ62507 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CochQ62507 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CochQ62507 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CochQ62507 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CochQ62507 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CochQ62507 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CochQ62507 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CochQ62507 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CochQ62507 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CochQ62507 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CochQ62507 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CochQ62507 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CochQ62507 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CochQ62507 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CochQ62507 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CochQ62507 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CochQ62507 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CochQ62507 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CochQ62507 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CochQ62507 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CochQ62507 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CochQ62507 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CochQ62507 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CochQ62507 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CochQ62507 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CochQ62507 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CochQ62507 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CochQ62507 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CochQ62507 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CochQ62507 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CochQ62507 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CochQ62507 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CochQ62507 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CochQ62507 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CochQ62507 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CochQ62507 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CochQ62507 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CochQ62507 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CochQ62507 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CochQ62507 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CochQ62507 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CochQ62507 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CochQ62507 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CochQ62507 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CochQ62507 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CochQ62507 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CochQ62507 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CochQ62507 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CochQ62507 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms