Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sin3bQ62141 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sin3bQ62141 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sin3bQ62141 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms