Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf1Q61999 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf1Q61999 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf1Q61999 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf1Q61999 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf1Q61999 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf1Q61999 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf1Q61999 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf1Q61999 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf1Q61999 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf1Q61999 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf1Q61999 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf1Q61999 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf1Q61999 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf1Q61999 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf1Q61999 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf1Q61999 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf1Q61999 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf1Q61999 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf1Q61999 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Odf1Q61999 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Odf1Q61999 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Odf1Q61999 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Odf1Q61999 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Odf1Q61999 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Odf1Q61999 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Odf1Q61999 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Odf1Q61999 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Odf1Q61999 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Odf1Q61999 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Odf1Q61999 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Odf1Q61999 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Odf1Q61999 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Odf1Q61999 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Odf1Q61999 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Odf1Q61999 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Odf1Q61999 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Odf1Q61999 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf1Q61999 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf1Q61999 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf1Q61999 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Odf1Q61999 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Odf1Q61999 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Odf1Q61999 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf1Q61999 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf1Q61999 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Odf1Q61999 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Odf1Q61999 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf1Q61999 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Odf1Q61999 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Odf1Q61999 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf1Q61999 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf1Q61999 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf1Q61999 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf1Q61999 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf1Q61999 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Odf1Q61999 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Odf1Q61999 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf1Q61999 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf1Q61999 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf1Q61999 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Odf1Q61999 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Odf1Q61999 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Odf1Q61999 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Odf1Q61999 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf1Q61999 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Odf1Q61999 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Odf1Q61999 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf1Q61999 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf1Q61999 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf1Q61999 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf1Q61999 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf1Q61999 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Odf1Q61999 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf1Q61999 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf1Q61999 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Odf1Q61999 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf1Q61999 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf1Q61999 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf1Q61999 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf1Q61999 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf1Q61999 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Odf1Q61999 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Odf1Q61999 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf1Q61999 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf1Q61999 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf1Q61999 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Odf1Q61999 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf1Q61999 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Odf1Q61999 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf1Q61999 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Odf1Q61999 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf1Q61999 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf1Q61999 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf1Q61999 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Odf1Q61999 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf1Q61999 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf1Q61999 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Odf1Q61999 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf1Q61999 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms