Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Itga7Q61738 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Itga7Q61738 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Itga7Q61738 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga7Q61738 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga7Q61738 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga7Q61738 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga7Q61738 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga7Q61738 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga7Q61738 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga7Q61738 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga7Q61738 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga7Q61738 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga7Q61738 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga7Q61738 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga7Q61738 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga7Q61738 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga7Q61738 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga7Q61738 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga7Q61738 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga7Q61738 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga7Q61738 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga7Q61738 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga7Q61738 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga7Q61738 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga7Q61738 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga7Q61738 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga7Q61738 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga7Q61738 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga7Q61738 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga7Q61738 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga7Q61738 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga7Q61738 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga7Q61738 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga7Q61738 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga7Q61738 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga7Q61738 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga7Q61738 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga7Q61738 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga7Q61738 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga7Q61738 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga7Q61738 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga7Q61738 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga7Q61738 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga7Q61738 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga7Q61738 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga7Q61738 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga7Q61738 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga7Q61738 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga7Q61738 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms