Protein–RNA interactions for Protein: Q61704

Itih3, Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itih3Q61704 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itih3Q61704 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itih3Q61704 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itih3Q61704 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itih3Q61704 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itih3Q61704 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itih3Q61704 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Itih3Q61704 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itih3Q61704 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itih3Q61704 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itih3Q61704 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itih3Q61704 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itih3Q61704 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Itih3Q61704 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Itih3Q61704 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itih3Q61704 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itih3Q61704 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itih3Q61704 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itih3Q61704 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itih3Q61704 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itih3Q61704 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itih3Q61704 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Itih3Q61704 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itih3Q61704 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itih3Q61704 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itih3Q61704 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itih3Q61704 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itih3Q61704 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itih3Q61704 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itih3Q61704 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Itih3Q61704 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itih3Q61704 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itih3Q61704 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itih3Q61704 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itih3Q61704 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itih3Q61704 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itih3Q61704 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itih3Q61704 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itih3Q61704 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itih3Q61704 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itih3Q61704 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itih3Q61704 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itih3Q61704 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itih3Q61704 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itih3Q61704 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itih3Q61704 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itih3Q61704 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itih3Q61704 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itih3Q61704 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms