Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TefmQ5SSK3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TefmQ5SSK3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1299.6 ms