Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG0

Slc27a5, Bile acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a5Q4LDG0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc27a5Q4LDG0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc27a5Q4LDG0 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc27a5Q4LDG0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc27a5Q4LDG0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc27a5Q4LDG0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc27a5Q4LDG0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc27a5Q4LDG0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc27a5Q4LDG0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc27a5Q4LDG0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc27a5Q4LDG0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc27a5Q4LDG0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc27a5Q4LDG0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc27a5Q4LDG0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc27a5Q4LDG0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc27a5Q4LDG0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc27a5Q4LDG0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc27a5Q4LDG0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc27a5Q4LDG0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc27a5Q4LDG0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc27a5Q4LDG0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc27a5Q4LDG0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc27a5Q4LDG0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc27a5Q4LDG0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc27a5Q4LDG0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc27a5Q4LDG0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc27a5Q4LDG0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc27a5Q4LDG0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc27a5Q4LDG0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc27a5Q4LDG0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc27a5Q4LDG0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc27a5Q4LDG0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc27a5Q4LDG0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc27a5Q4LDG0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc27a5Q4LDG0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc27a5Q4LDG0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc27a5Q4LDG0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc27a5Q4LDG0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc27a5Q4LDG0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc27a5Q4LDG0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc27a5Q4LDG0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc27a5Q4LDG0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Slc27a5Q4LDG0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc27a5Q4LDG0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms