Protein–RNA interactions for Protein: Q3V209

Tmub2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub2Q3V209 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmub2Q3V209 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms