Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Kdm5aQ3UXZ9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Kdm5aQ3UXZ9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Kdm5aQ3UXZ9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Kdm5aQ3UXZ9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Kdm5aQ3UXZ9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Kdm5aQ3UXZ9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Kdm5aQ3UXZ9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Kdm5aQ3UXZ9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kdm5aQ3UXZ9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kdm5aQ3UXZ9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Kdm5aQ3UXZ9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kdm5aQ3UXZ9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Kdm5aQ3UXZ9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Kdm5aQ3UXZ9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Kdm5aQ3UXZ9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Kdm5aQ3UXZ9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Kdm5aQ3UXZ9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Kdm5aQ3UXZ9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Kdm5aQ3UXZ9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kdm5aQ3UXZ9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kdm5aQ3UXZ9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kdm5aQ3UXZ9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Kdm5aQ3UXZ9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kdm5aQ3UXZ9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kdm5aQ3UXZ9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5aQ3UXZ9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5aQ3UXZ9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5aQ3UXZ9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5aQ3UXZ9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm5aQ3UXZ9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm5aQ3UXZ9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm5aQ3UXZ9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm5aQ3UXZ9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm5aQ3UXZ9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm5aQ3UXZ9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kdm5aQ3UXZ9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kdm5aQ3UXZ9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kdm5aQ3UXZ9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kdm5aQ3UXZ9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kdm5aQ3UXZ9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
Kdm5aQ3UXZ9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kdm5aQ3UXZ9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Kdm5aQ3UXZ9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kdm5aQ3UXZ9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Kdm5aQ3UXZ9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kdm5aQ3UXZ9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kdm5aQ3UXZ9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kdm5aQ3UXZ9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kdm5aQ3UXZ9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kdm5aQ3UXZ9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kdm5aQ3UXZ9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kdm5aQ3UXZ9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kdm5aQ3UXZ9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kdm5aQ3UXZ9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kdm5aQ3UXZ9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kdm5aQ3UXZ9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kdm5aQ3UXZ9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kdm5aQ3UXZ9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kdm5aQ3UXZ9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm5aQ3UXZ9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm5aQ3UXZ9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm5aQ3UXZ9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm5aQ3UXZ9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm5aQ3UXZ9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm5aQ3UXZ9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm5aQ3UXZ9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm5aQ3UXZ9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm5aQ3UXZ9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm5aQ3UXZ9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm5aQ3UXZ9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kdm5aQ3UXZ9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kdm5aQ3UXZ9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kdm5aQ3UXZ9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kdm5aQ3UXZ9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kdm5aQ3UXZ9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kdm5aQ3UXZ9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kdm5aQ3UXZ9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
Kdm5aQ3UXZ9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Kdm5aQ3UXZ9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Kdm5aQ3UXZ9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Kdm5aQ3UXZ9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kdm5aQ3UXZ9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kdm5aQ3UXZ9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Kdm5aQ3UXZ9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kdm5aQ3UXZ9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kdm5aQ3UXZ9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kdm5aQ3UXZ9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kdm5aQ3UXZ9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kdm5aQ3UXZ9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kdm5aQ3UXZ9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
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