Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-Eb2Q3UUV9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms