Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Klhdc9Q3USL1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klhdc9Q3USL1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klhdc9Q3USL1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Klhdc9Q3USL1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klhdc9Q3USL1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klhdc9Q3USL1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klhdc9Q3USL1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klhdc9Q3USL1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klhdc9Q3USL1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klhdc9Q3USL1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Klhdc9Q3USL1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klhdc9Q3USL1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klhdc9Q3USL1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klhdc9Q3USL1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klhdc9Q3USL1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Klhdc9Q3USL1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klhdc9Q3USL1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klhdc9Q3USL1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klhdc9Q3USL1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klhdc9Q3USL1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhdc9Q3USL1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhdc9Q3USL1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhdc9Q3USL1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhdc9Q3USL1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhdc9Q3USL1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhdc9Q3USL1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhdc9Q3USL1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhdc9Q3USL1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhdc9Q3USL1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhdc9Q3USL1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhdc9Q3USL1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhdc9Q3USL1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhdc9Q3USL1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klhdc9Q3USL1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klhdc9Q3USL1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klhdc9Q3USL1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klhdc9Q3USL1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klhdc9Q3USL1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klhdc9Q3USL1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Klhdc9Q3USL1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Klhdc9Q3USL1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Klhdc9Q3USL1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Klhdc9Q3USL1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Klhdc9Q3USL1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Klhdc9Q3USL1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Klhdc9Q3USL1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Klhdc9Q3USL1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Klhdc9Q3USL1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Klhdc9Q3USL1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Klhdc9Q3USL1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klhdc9Q3USL1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klhdc9Q3USL1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klhdc9Q3USL1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klhdc9Q3USL1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klhdc9Q3USL1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klhdc9Q3USL1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klhdc9Q3USL1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klhdc9Q3USL1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klhdc9Q3USL1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Klhdc9Q3USL1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Klhdc9Q3USL1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Klhdc9Q3USL1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Klhdc9Q3USL1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Klhdc9Q3USL1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Klhdc9Q3USL1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klhdc9Q3USL1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klhdc9Q3USL1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klhdc9Q3USL1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klhdc9Q3USL1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klhdc9Q3USL1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Klhdc9Q3USL1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klhdc9Q3USL1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klhdc9Q3USL1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klhdc9Q3USL1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klhdc9Q3USL1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhdc9Q3USL1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhdc9Q3USL1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhdc9Q3USL1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhdc9Q3USL1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhdc9Q3USL1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhdc9Q3USL1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhdc9Q3USL1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhdc9Q3USL1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhdc9Q3USL1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhdc9Q3USL1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhdc9Q3USL1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhdc9Q3USL1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhdc9Q3USL1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhdc9Q3USL1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhdc9Q3USL1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhdc9Q3USL1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Klhdc9Q3USL1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Klhdc9Q3USL1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Klhdc9Q3USL1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Klhdc9Q3USL1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Klhdc9Q3USL1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms