Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cobll1Q3UMF0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cobll1Q3UMF0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cobll1Q3UMF0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms