Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc33Q3ULW6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc33Q3ULW6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc33Q3ULW6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc33Q3ULW6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc33Q3ULW6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc33Q3ULW6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc33Q3ULW6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc33Q3ULW6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc33Q3ULW6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc33Q3ULW6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc33Q3ULW6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms