Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK37

Uncharacterized protein C14orf80 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UK37 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Q3UK37 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q3UK37 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q3UK37 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q3UK37 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3UK37 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3UK37 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3UK37 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3UK37 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3UK37 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3UK37 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3UK37 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3UK37 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3UK37 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3UK37 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3UK37 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3UK37 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3UK37 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3UK37 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3UK37 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3UK37 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3UK37 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3UK37 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3UK37 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3UK37 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q3UK37 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q3UK37 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q3UK37 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Q3UK37 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q3UK37 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Q3UK37 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q3UK37 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q3UK37 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q3UK37 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q3UK37 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q3UK37 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q3UK37 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q3UK37 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q3UK37 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q3UK37 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q3UK37 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3UK37 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3UK37 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3UK37 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3UK37 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3UK37 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3UK37 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3UK37 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3UK37 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3UK37 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3UK37 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3UK37 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3UK37 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3UK37 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3UK37 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3UK37 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3UK37 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3UK37 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3UK37 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3UK37 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3UK37 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3UK37 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3UK37 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3UK37 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Q3UK37 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3UK37 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3UK37 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3UK37 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3UK37 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3UK37 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3UK37 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3UK37 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3UK37 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3UK37 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3UK37 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3UK37 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3UK37 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3UK37 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3UK37 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q3UK37 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q3UK37 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q3UK37 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q3UK37 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q3UK37 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q3UK37 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q3UK37 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q3UK37 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q3UK37 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3UK37 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3UK37 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3UK37 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3UK37 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3UK37 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3UK37 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3UK37 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3UK37 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3UK37 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3UK37 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3UK37 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3UK37 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms