Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpr55Q3UJF0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gpr55Q3UJF0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gpr55Q3UJF0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gpr55Q3UJF0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpr55Q3UJF0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpr55Q3UJF0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpr55Q3UJF0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpr55Q3UJF0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpr55Q3UJF0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpr55Q3UJF0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpr55Q3UJF0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms