Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc177Q3UHB8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc177Q3UHB8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms