Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trafd1Q3UDK1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms