Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Otud5Q3U2S4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Otud5Q3U2S4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Otud5Q3U2S4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Otud5Q3U2S4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Otud5Q3U2S4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Otud5Q3U2S4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Otud5Q3U2S4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Otud5Q3U2S4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Otud5Q3U2S4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Otud5Q3U2S4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Otud5Q3U2S4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Otud5Q3U2S4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Otud5Q3U2S4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Otud5Q3U2S4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Otud5Q3U2S4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Otud5Q3U2S4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Otud5Q3U2S4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Otud5Q3U2S4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Otud5Q3U2S4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Otud5Q3U2S4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Otud5Q3U2S4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Otud5Q3U2S4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Otud5Q3U2S4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Otud5Q3U2S4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Otud5Q3U2S4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Otud5Q3U2S4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Otud5Q3U2S4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Otud5Q3U2S4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Otud5Q3U2S4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Otud5Q3U2S4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Otud5Q3U2S4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Otud5Q3U2S4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Otud5Q3U2S4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Otud5Q3U2S4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Otud5Q3U2S4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Otud5Q3U2S4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Otud5Q3U2S4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Otud5Q3U2S4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Otud5Q3U2S4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Otud5Q3U2S4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Otud5Q3U2S4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Otud5Q3U2S4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Otud5Q3U2S4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Otud5Q3U2S4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Otud5Q3U2S4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Otud5Q3U2S4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Otud5Q3U2S4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Otud5Q3U2S4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Otud5Q3U2S4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Otud5Q3U2S4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Otud5Q3U2S4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Otud5Q3U2S4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Otud5Q3U2S4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Otud5Q3U2S4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Otud5Q3U2S4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Otud5Q3U2S4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Otud5Q3U2S4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Otud5Q3U2S4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Otud5Q3U2S4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Otud5Q3U2S4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Otud5Q3U2S4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms