Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V1

Khsrp, Far upstream element-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KhsrpQ3U0V1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KhsrpQ3U0V1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KhsrpQ3U0V1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms