Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3TQQ9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms