Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Smarca4Q3TKT4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Smarca4Q3TKT4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Smarca4Q3TKT4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Smarca4Q3TKT4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Smarca4Q3TKT4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Smarca4Q3TKT4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Smarca4Q3TKT4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Smarca4Q3TKT4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Smarca4Q3TKT4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Smarca4Q3TKT4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Smarca4Q3TKT4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Smarca4Q3TKT4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Smarca4Q3TKT4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Smarca4Q3TKT4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Smarca4Q3TKT4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Smarca4Q3TKT4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
Smarca4Q3TKT4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Smarca4Q3TKT4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Smarca4Q3TKT4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Smarca4Q3TKT4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Smarca4Q3TKT4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Smarca4Q3TKT4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Smarca4Q3TKT4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Smarca4Q3TKT4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Smarca4Q3TKT4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Smarca4Q3TKT4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Smarca4Q3TKT4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Smarca4Q3TKT4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Smarca4Q3TKT4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Smarca4Q3TKT4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
Smarca4Q3TKT4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Smarca4Q3TKT4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Smarca4Q3TKT4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Smarca4Q3TKT4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Smarca4Q3TKT4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Smarca4Q3TKT4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Smarca4Q3TKT4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Smarca4Q3TKT4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Smarca4Q3TKT4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Smarca4Q3TKT4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Smarca4Q3TKT4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Smarca4Q3TKT4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Smarca4Q3TKT4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Smarca4Q3TKT4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Smarca4Q3TKT4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Smarca4Q3TKT4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Smarca4Q3TKT4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Smarca4Q3TKT4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
Smarca4Q3TKT4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Smarca4Q3TKT4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Smarca4Q3TKT4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Smarca4Q3TKT4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Smarca4Q3TKT4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Smarca4Q3TKT4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Smarca4Q3TKT4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Smarca4Q3TKT4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Smarca4Q3TKT4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Smarca4Q3TKT4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Smarca4Q3TKT4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Smarca4Q3TKT4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Smarca4Q3TKT4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Smarca4Q3TKT4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Smarca4Q3TKT4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Smarca4Q3TKT4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Smarca4Q3TKT4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Smarca4Q3TKT4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Smarca4Q3TKT4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Smarca4Q3TKT4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Smarca4Q3TKT4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Smarca4Q3TKT4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Smarca4Q3TKT4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Smarca4Q3TKT4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Smarca4Q3TKT4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Smarca4Q3TKT4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Smarca4Q3TKT4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Smarca4Q3TKT4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Smarca4Q3TKT4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Smarca4Q3TKT4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Smarca4Q3TKT4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Smarca4Q3TKT4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Smarca4Q3TKT4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Smarca4Q3TKT4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Smarca4Q3TKT4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Smarca4Q3TKT4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Smarca4Q3TKT4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
Smarca4Q3TKT4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Smarca4Q3TKT4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Smarca4Q3TKT4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Smarca4Q3TKT4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Smarca4Q3TKT4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Smarca4Q3TKT4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Smarca4Q3TKT4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Smarca4Q3TKT4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Smarca4Q3TKT4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Smarca4Q3TKT4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Smarca4Q3TKT4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Smarca4Q3TKT4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Smarca4Q3TKT4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Smarca4Q3TKT4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms